Ученые из Детского исследовательского госпиталя Святого Иуды создали новый инструмент ReDeconv, который помогает анализировать данные о генах глубже, исправляя ошибки, которые могут возникать при обработке информации о РНК.
Современные методы анализа РНК, такие как массовое и одиночное секвенирование РНК, позволяют изучать активность генов очень детально. Однако некоторые вычислительные методы обработки данных могут упрощать анализ, пропуская важные детали. Это может привести к неправильным выводам, особенно при сравнении разных типов клеток.
ReDeconv исправляет основные ошибки в вычислениях, учитывая различия в объеме информации о генах. Например, количество активных генов в разных клетках может сильно отличаться: красные кровяные клетки в основном занимаются синтезом гемоглобина, в то время как стволовые клетки активируют тысячи генов. Традиционные методы часто не учитывают такие различия, что может привести к неправильному анализу данных.
ReDeconv учитывает объем информации о генах, что значительно повышает точность анализа данных о генах, — объясняет автор исследования Цзиян Юй, который работает в госпитале Святого Иуды.
Использование ReDeconv позволяет точнее определить типы клеток в образце и уменьшить возможные ошибки из-за различий в активности генов и их длине. По словам первого автора статьи, Сонгцзяня Лу, новый инструмент улучшает точность обработки данных и раскрывает дополнительные сведения, которые раньше могли быть упущены.
ReDeconv: обнаружены ошибки в тысячах исследований РНК
